Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THY1P04216 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
THY1P04216 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
THY1P04216 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
THY1P04216 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
THY1P04216 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
THY1P04216 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
THY1P04216 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
THY1P04216 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
THY1P04216 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
THY1P04216 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
THY1P04216 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
THY1P04216 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
THY1P04216 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
THY1P04216 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
THY1P04216 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
THY1P04216 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
THY1P04216 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
THY1P04216 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
THY1P04216 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
THY1P04216 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
THY1P04216 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
THY1P04216 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
THY1P04216 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
THY1P04216 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
THY1P04216 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
THY1P04216 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
THY1P04216 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
THY1P04216 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
THY1P04216 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
THY1P04216 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
THY1P04216 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
THY1P04216 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
THY1P04216 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
THY1P04216 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
THY1P04216 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
THY1P04216 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
THY1P04216 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
THY1P04216 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
THY1P04216 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
THY1P04216 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
THY1P04216 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
THY1P04216 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
THY1P04216 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
THY1P04216 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
THY1P04216 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
THY1P04216 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
THY1P04216 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
THY1P04216 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
THY1P04216 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
THY1P04216 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
THY1P04216 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
THY1P04216 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
THY1P04216 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
THY1P04216 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
THY1P04216 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
THY1P04216 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
THY1P04216 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
THY1P04216 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
THY1P04216 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
THY1P04216 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
THY1P04216 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
THY1P04216 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
THY1P04216 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
THY1P04216 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
THY1P04216 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
THY1P04216 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
THY1P04216 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
THY1P04216 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
THY1P04216 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
THY1P04216 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
THY1P04216 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
THY1P04216 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
THY1P04216 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
THY1P04216 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
THY1P04216 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
THY1P04216 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
THY1P04216 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
THY1P04216 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
THY1P04216 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
THY1P04216 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
THY1P04216 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
THY1P04216 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
THY1P04216 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
THY1P04216 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
THY1P04216 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
THY1P04216 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
THY1P04216 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
THY1P04216 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
THY1P04216 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
THY1P04216 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
THY1P04216 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
THY1P04216 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
THY1P04216 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
THY1P04216 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
THY1P04216 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
THY1P04216 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
THY1P04216 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
THY1P04216 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
THY1P04216 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms