Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFNB1P01574 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFNB1P01574 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms