Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
GABARAPO95166 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPO95166 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms