Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNSO60931 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNSO60931 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNSO60931 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNSO60931 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNSO60931 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNSO60931 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNSO60931 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNSO60931 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNSO60931 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNSO60931 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNSO60931 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNSO60931 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNSO60931 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNSO60931 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNSO60931 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNSO60931 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNSO60931 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNSO60931 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNSO60931 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNSO60931 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNSO60931 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNSO60931 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNSO60931 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNSO60931 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNSO60931 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNSO60931 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNSO60931 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNSO60931 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNSO60931 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNSO60931 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNSO60931 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNSO60931 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNSO60931 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNSO60931 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNSO60931 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNSO60931 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNSO60931 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNSO60931 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNSO60931 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNSO60931 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNSO60931 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNSO60931 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNSO60931 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNSO60931 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNSO60931 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNSO60931 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNSO60931 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNSO60931 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNSO60931 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNSO60931 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNSO60931 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNSO60931 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNSO60931 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNSO60931 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNSO60931 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNSO60931 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNSO60931 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNSO60931 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNSO60931 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNSO60931 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNSO60931 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNSO60931 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNSO60931 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNSO60931 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNSO60931 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNSO60931 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNSO60931 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNSO60931 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNSO60931 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNSO60931 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNSO60931 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNSO60931 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNSO60931 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNSO60931 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNSO60931 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNSO60931 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNSO60931 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNSO60931 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNSO60931 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNSO60931 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNSO60931 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNSO60931 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNSO60931 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNSO60931 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNSO60931 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNSO60931 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNSO60931 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNSO60931 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNSO60931 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNSO60931 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNSO60931 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNSO60931 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNSO60931 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNSO60931 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNSO60931 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNSO60931 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNSO60931 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CTNSO60931 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNSO60931 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms