Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.42e-10■■■■■ 43
DKC1O60832 JRK-208ENST00000591357 571 ntTSL 423.76■■□□□ 1.392e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.232e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 FOXN3-211ENST00000555855 851 ntTSL 521.77■■□□□ 1.082e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.762e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 C15orf38-AP3S2-203ENST00000559629 675 ntTSL 319.19■□□□□ 0.662e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 PRKCD-203ENST00000464818 777 ntTSL 518.92■□□□□ 0.622e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 JRK-201ENST00000503272 587 ntTSL 418.37■□□□□ 0.532e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.432e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.412e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.42e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.42e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.375e-18■■■■■ 42.9
DKC1O60832 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.362e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.335e-18■■■■■ 42.9
DKC1O60832 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.32e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.295e-18■■■■■ 42.9
DKC1O60832 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.255e-18■■■■■ 42.9
DKC1O60832 C15orf38-AP3S2-202ENST00000558648 664 ntTSL 515.07■□□□□ 02e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.085e-18■■■■■ 42.9
DKC1O60832 ITFG2-214ENST00000552005 709 ntTSL 314.52□□□□□ -0.092e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 THRAP3-203ENST00000469141 3339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.222e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 AP3S2-202ENST00000423566 1262 ntTSL 212.85□□□□□ -0.352e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 AP3S2-201ENST00000336418 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.42e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 THRAP3-201ENST00000354618 4432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.42e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 AP3S2-206ENST00000558806 578 ntTSL 1 (best)12.01□□□□□ -0.492e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 TNFSF14-201ENST00000245912 4336 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.522e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 AP3S2-209ENST00000559162 357 ntTSL 211.73□□□□□ -0.532e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 AL137230.2-201ENST00000555070 452 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.852e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 AP3S2-203ENST00000557999 578 ntTSL 49.18□□□□□ -0.942e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 AP3S2-205ENST00000558186 401 ntTSL 48.87□□□□□ -0.992e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -12e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 FOXN3-208ENST00000555034 505 ntTSL 38.69□□□□□ -1.022e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 AP3S2-208ENST00000558999 653 ntTSL 58.69□□□□□ -1.022e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 TNKS-205ENST00000518027 766 ntTSL 38.06□□□□□ -1.122e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.192e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 FOXN3-205ENST00000553904 337 ntTSL 37.38□□□□□ -1.232e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 NT5DC1-204ENST00000460749 907 ntTSL 56.83□□□□□ -1.322e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 THRAP3-202ENST00000466743 537 ntTSL 26.14□□□□□ -1.432e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 HSD17B4-223ENST00000518349 815 ntTSL 54.83□□□□□ -1.642e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 TNKS-212ENST00000521039 745 ntTSL 33.68□□□□□ -1.822e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 HSD17B4-226ENST00000520244 449 ntTSL 33.5□□□□□ -1.852e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.97□□□□□ -2.092e-9■■■■■ 42.9
DKC1O60832 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.238e-7■■■■■ 42.9
DKC1O60832 NCOR2-215ENST00000458234 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)15.52■□□□□ 0.078e-7■■■■■ 42.9
DKC1O60832 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.058e-7■■■■■ 42.9
DKC1O60832 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.138e-7■■■■■ 42.9
DKC1O60832 LINC00888-203ENST00000482098 794 ntTSL 27.78□□□□□ -1.167e-72■■■■■ 42.9
DKC1O60832 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.84□□□□□ -1.797e-72■■■■■ 42.9
DKC1O60832 TBC1D16-201ENST00000310924 10936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 42.7
DKC1O60832 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.66■□□□□ 0.582e-56■■■■■ 42.7
DKC1O60832 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.262e-56■■■■■ 42.7
DKC1O60832 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.431e-323■■■■■ 42.6
DKC1O60832 SNHG22-202ENST00000615535 421 nt16.88■□□□□ 0.291e-323■■■■■ 42.6
DKC1O60832 CUX1-216ENST00000558469 588 ntTSL 410.75□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 42.6
DKC1O60832 NPHP4-209ENST00000489180 5548 ntTSL 219.38■□□□□ 0.691e-6■■■■■ 42.6
DKC1O60832 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 42.6
DKC1O60832 NPHP4-208ENST00000478423 4467 ntTSL 215.84■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 42.6
DKC1O60832 NPHP4-203ENST00000378169 4213 ntTSL 1 (best)14.54□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 42.6
DKC1O60832 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.794e-7■■■■■ 42.5
DKC1O60832 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.444e-7■■■■■ 42.5
DKC1O60832 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.344e-7■■■■■ 42.5
DKC1O60832 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.451e-6■■■■■ 42.5
DKC1O60832 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 42.5
DKC1O60832 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.575e-7■■■■■ 42.4
DKC1O60832 QRICH2-203ENST00000524722 2253 ntTSL 1 (best)14.59□□□□□ -0.075e-7■■■■■ 42.4
DKC1O60832 QRICH2-201ENST00000262765 5357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.255e-7■■■■■ 42.4
DKC1O60832 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.151e-8■■■■■ 42.4
DKC1O60832 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.121e-8■■■■■ 42.4
DKC1O60832 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.321e-8■■■■■ 42.4
DKC1O60832 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.381e-8■■■■■ 42.4
DKC1O60832 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.621e-8■■■■■ 42.4
DKC1O60832 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.57■□□□□ 0.562e-7■■■■■ 42.4
DKC1O60832 TAF1D-212ENST00000529794 1123 ntTSL 24.17□□□□□ -1.741e-323■■■■■ 42.4
DKC1O60832 TAF1D-218ENST00000533794 505 ntTSL 23.04□□□□□ -1.921e-323■■■■■ 42.4
DKC1O60832 ADAMTS10-208ENST00000596709 980 ntTSL 528.22■■■□□ 2.114e-7■■■■■ 42.2
DKC1O60832 ADAMTS10-202ENST00000593534 630 ntTSL 324.41■■□□□ 1.54e-7■■■■■ 42.2
DKC1O60832 TRIM8-202ENST00000462202 891 ntTSL 524.3■■□□□ 1.489e-7■■■■■ 42.2
DKC1O60832 RASSF4-211ENST00000489171 4350 ntTSL 1 (best)20.95■□□□□ 0.945e-9■■■■■ 42.2
DKC1O60832 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.629e-7■■■■■ 42.2
DKC1O60832 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.514e-9■■■■■ 42.2
DKC1O60832 RASSF4-202ENST00000427758 528 ntTSL 317.01■□□□□ 0.315e-9■■■■■ 42.2
DKC1O60832 RASSF4-209ENST00000483709 734 ntTSL 516.51■□□□□ 0.235e-9■■■■■ 42.2
DKC1O60832 ADAMTS10-207ENST00000596466 836 ntTSL 515.54■□□□□ 0.084e-7■■■■■ 42.2
DKC1O60832 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.054e-9■■■■■ 42.2
DKC1O60832 ADAMTS10-209ENST00000596851 3423 ntTSL 214.75□□□□□ -0.054e-7■■■■■ 42.2
DKC1O60832 NADSYN1-207ENST00000526039 769 ntTSL 513.91□□□□□ -0.184e-9■■■■■ 42.2
DKC1O60832 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.24e-7■■■■■ 42.2
DKC1O60832 NADSYN1-215ENST00000529840 820 ntTSL 512.82□□□□□ -0.364e-9■■■■■ 42.2
DKC1O60832 NADSYN1-219ENST00000531236 3429 ntTSL 211.95□□□□□ -0.54e-9■■■■■ 42.2
DKC1O60832 NADSYN1-204ENST00000525200 3616 ntTSL 210.28□□□□□ -0.764e-9■■■■■ 42.2
DKC1O60832 RASSF4-201ENST00000340258 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.775e-9■■■■■ 42.2
DKC1O60832 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.21e-42■■■■■ 42.1
DKC1O60832 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.021e-42■■■■■ 42.1
DKC1O60832 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.031e-42■■■■■ 42.1
DKC1O60832 LSM14A-206ENST00000588582 3601 ntTSL 211.35□□□□□ -0.591e-42■■■■■ 42.1
DKC1O60832 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.655e-7■■■■■ 41.9
DKC1O60832 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.215e-7■■■■■ 41.9
DKC1O60832 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.15e-7■■■■■ 41.9
DKC1O60832 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.385e-7■■■■■ 41.9
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