Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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GGTLC3B5MD39 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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GGTLC3B5MD39 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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GGTLC3B5MD39 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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GGTLC3B5MD39 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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GGTLC3B5MD39 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GGTLC3B5MD39 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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GGTLC3B5MD39 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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GGTLC3B5MD39 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGTLC3B5MD39 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGTLC3B5MD39 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGTLC3B5MD39 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGTLC3B5MD39 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGTLC3B5MD39 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGTLC3B5MD39 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGTLC3B5MD39 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGTLC3B5MD39 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GGTLC3B5MD39 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGTLC3B5MD39 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGTLC3B5MD39 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGTLC3B5MD39 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGTLC3B5MD39 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGTLC3B5MD39 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGTLC3B5MD39 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGTLC3B5MD39 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGTLC3B5MD39 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGTLC3B5MD39 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGTLC3B5MD39 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGTLC3B5MD39 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGTLC3B5MD39 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGTLC3B5MD39 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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