Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B4DGG1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
B4DGG1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
B4DGG1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B4DGG1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B4DGG1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
B4DGG1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B4DGG1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
B4DGG1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B4DGG1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
B4DGG1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B4DGG1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
B4DGG1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B4DGG1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
B4DGG1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
B4DGG1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B4DGG1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
B4DGG1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B4DGG1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
B4DGG1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
B4DGG1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B4DGG1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B4DGG1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
B4DGG1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
B4DGG1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B4DGG1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
B4DGG1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
B4DGG1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
B4DGG1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
B4DGG1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
B4DGG1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
B4DGG1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
B4DGG1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
B4DGG1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
B4DGG1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
B4DGG1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
B4DGG1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B4DGG1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
B4DGG1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
B4DGG1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B4DGG1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
B4DGG1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
B4DGG1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
B4DGG1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B4DGG1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B4DGG1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B4DGG1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
B4DGG1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B4DGG1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4DGG1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4DGG1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4DGG1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4DGG1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
B4DGG1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4DGG1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4DGG1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4DGG1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4DGG1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4DGG1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4DGG1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
B4DGG1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B4DGG1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
B4DGG1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B4DGG1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4DGG1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4DGG1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4DGG1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4DGG1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4DGG1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4DGG1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4DGG1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4DGG1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
B4DGG1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
B4DGG1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B4DGG1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
B4DGG1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
B4DGG1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B4DGG1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B4DGG1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
B4DGG1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
B4DGG1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
B4DGG1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
B4DGG1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
B4DGG1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
B4DGG1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
B4DGG1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
B4DGG1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4DGG1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4DGG1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4DGG1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4DGG1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
B4DGG1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4DGG1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4DGG1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
B4DGG1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4DGG1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4DGG1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4DGG1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4DGG1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4DGG1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.6 ms