Protein–RNA interactions for Protein: A8MRT5

NPIPB5, Nuclear pore complex-interacting protein family member B5, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB5A8MRT5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NPIPB5A8MRT5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPIPB5A8MRT5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPIPB5A8MRT5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPIPB5A8MRT5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPIPB5A8MRT5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPIPB5A8MRT5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPIPB5A8MRT5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPIPB5A8MRT5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPIPB5A8MRT5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPIPB5A8MRT5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NPIPB5A8MRT5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPIPB5A8MRT5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB5A8MRT5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB5A8MRT5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB5A8MRT5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB5A8MRT5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB5A8MRT5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB5A8MRT5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB5A8MRT5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB5A8MRT5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB5A8MRT5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB5A8MRT5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPB5A8MRT5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB5A8MRT5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NPIPB5A8MRT5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB5A8MRT5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB5A8MRT5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB5A8MRT5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB5A8MRT5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB5A8MRT5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB5A8MRT5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB5A8MRT5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB5A8MRT5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB5A8MRT5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB5A8MRT5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB5A8MRT5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB5A8MRT5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB5A8MRT5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB5A8MRT5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB5A8MRT5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB5A8MRT5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB5A8MRT5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB5A8MRT5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms