Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GOLGA6L9A6NEM1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.4 ms