Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT87PA6NCN2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT87PA6NCN2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT87PA6NCN2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms