Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A2

CYP46A1, Cholesterol 24-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP46A1Q9Y6A2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYP46A1Q9Y6A2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP46A1Q9Y6A2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CYP46A1Q9Y6A2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms