Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms