Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y375

NDUFAF1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF1Q9Y375 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFAF1Q9Y375 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAF1Q9Y375 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF1Q9Y375 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms