Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPR55Q9Y2T6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPR55Q9Y2T6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPR55Q9Y2T6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPR55Q9Y2T6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPR55Q9Y2T6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPR55Q9Y2T6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPR55Q9Y2T6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPR55Q9Y2T6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPR55Q9Y2T6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GPR55Q9Y2T6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPR55Q9Y2T6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GPR55Q9Y2T6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPR55Q9Y2T6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPR55Q9Y2T6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPR55Q9Y2T6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPR55Q9Y2T6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPR55Q9Y2T6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPR55Q9Y2T6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPR55Q9Y2T6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPR55Q9Y2T6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPR55Q9Y2T6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPR55Q9Y2T6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPR55Q9Y2T6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPR55Q9Y2T6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPR55Q9Y2T6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPR55Q9Y2T6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPR55Q9Y2T6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPR55Q9Y2T6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPR55Q9Y2T6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GPR55Q9Y2T6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms