Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL0

RCOR1, REST corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR1Q9UKL0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RCOR1Q9UKL0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RCOR1Q9UKL0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms