Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DDX25Q9UHL0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX25Q9UHL0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DDX25Q9UHL0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX25Q9UHL0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX25Q9UHL0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX25Q9UHL0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX25Q9UHL0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX25Q9UHL0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX25Q9UHL0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX25Q9UHL0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX25Q9UHL0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX25Q9UHL0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX25Q9UHL0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX25Q9UHL0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX25Q9UHL0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX25Q9UHL0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX25Q9UHL0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX25Q9UHL0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX25Q9UHL0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX25Q9UHL0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms