Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
IFT172Q9UG01 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
IFT172Q9UG01 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
IFT172Q9UG01 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
IFT172Q9UG01 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
IFT172Q9UG01 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
IFT172Q9UG01 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
IFT172Q9UG01 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
IFT172Q9UG01 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
IFT172Q9UG01 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
IFT172Q9UG01 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
IFT172Q9UG01 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
IFT172Q9UG01 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
IFT172Q9UG01 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
IFT172Q9UG01 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
IFT172Q9UG01 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
IFT172Q9UG01 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
IFT172Q9UG01 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
IFT172Q9UG01 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
IFT172Q9UG01 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
IFT172Q9UG01 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
IFT172Q9UG01 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
IFT172Q9UG01 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
IFT172Q9UG01 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
IFT172Q9UG01 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
IFT172Q9UG01 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
IFT172Q9UG01 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
IFT172Q9UG01 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
IFT172Q9UG01 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
IFT172Q9UG01 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
IFT172Q9UG01 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
IFT172Q9UG01 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
IFT172Q9UG01 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
IFT172Q9UG01 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
IFT172Q9UG01 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
IFT172Q9UG01 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
IFT172Q9UG01 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
IFT172Q9UG01 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
IFT172Q9UG01 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
IFT172Q9UG01 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
IFT172Q9UG01 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
IFT172Q9UG01 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
IFT172Q9UG01 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
IFT172Q9UG01 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
IFT172Q9UG01 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
IFT172Q9UG01 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
IFT172Q9UG01 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
IFT172Q9UG01 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
IFT172Q9UG01 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
IFT172Q9UG01 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
IFT172Q9UG01 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
IFT172Q9UG01 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
IFT172Q9UG01 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
IFT172Q9UG01 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
IFT172Q9UG01 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
IFT172Q9UG01 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
IFT172Q9UG01 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
IFT172Q9UG01 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
IFT172Q9UG01 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
IFT172Q9UG01 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
IFT172Q9UG01 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
IFT172Q9UG01 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
IFT172Q9UG01 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
IFT172Q9UG01 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
IFT172Q9UG01 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
IFT172Q9UG01 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
IFT172Q9UG01 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
IFT172Q9UG01 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms