Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.53■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
USP35Q9P2H5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
USP35Q9P2H5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
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