Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHCHD3Q9NX63 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms