Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PNPLA3Q9NST1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNPLA3Q9NST1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms