Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 745.5 ms