Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI7

KRCC1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1Q9NPI7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRCC1Q9NPI7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRCC1Q9NPI7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.1 ms