Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARD6AQ9NPB6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARD6AQ9NPB6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.4 ms