Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC6A20Q9NP91 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC6A20Q9NP91 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A20Q9NP91 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A20Q9NP91 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A20Q9NP91 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A20Q9NP91 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A20Q9NP91 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A20Q9NP91 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A20Q9NP91 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A20Q9NP91 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A20Q9NP91 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A20Q9NP91 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A20Q9NP91 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A20Q9NP91 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A20Q9NP91 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A20Q9NP91 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A20Q9NP91 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A20Q9NP91 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A20Q9NP91 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A20Q9NP91 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms