Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC40A1Q9NP59 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms