Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SIL1Q9H173 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SIL1Q9H173 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SIL1Q9H173 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms