Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNRNP25Q9BV90 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms