Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GINS3Q9BRX5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms