Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SH3GL3Q99963 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms