Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GCNAQ96QF7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms