Protein–RNA interactions for Protein: Q96MI6

PPM1M, Protein phosphatase 1M, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1MQ96MI6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1MQ96MI6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1MQ96MI6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms