Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM71F1Q96KD3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms