Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CCDC136Q96JN2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC136Q96JN2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC136Q96JN2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms