Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC34Q96HJ3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC34Q96HJ3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms