Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRC59Q96AG4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRC59Q96AG4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRC59Q96AG4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms