Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKD1Q969G9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKD1Q969G9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NKD1Q969G9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms