Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATRIPQ8WXE1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATRIPQ8WXE1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms