Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI5

SLC44A1, Choline transporter-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A1Q8WWI5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC44A1Q8WWI5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC44A1Q8WWI5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms