Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9S9

SNX31, Sorting nexin-31, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX31Q8N9S9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX31Q8N9S9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX31Q8N9S9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms