Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2H9

PELI3, E3 ubiquitin-protein ligase pellino homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PELI3Q8N2H9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PELI3Q8N2H9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PELI3Q8N2H9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PELI3Q8N2H9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms