Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVJ8

APRG1, AP20 region protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APRG1Q8IVJ8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APRG1Q8IVJ8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APRG1Q8IVJ8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms