Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
STRCQ7RTU9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
STRCQ7RTU9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
STRCQ7RTU9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
STRCQ7RTU9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.82■■■■□ 3
STRCQ7RTU9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
STRCQ7RTU9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
STRCQ7RTU9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
STRCQ7RTU9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
STRCQ7RTU9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
STRCQ7RTU9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
STRCQ7RTU9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
STRCQ7RTU9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
STRCQ7RTU9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
STRCQ7RTU9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
STRCQ7RTU9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
STRCQ7RTU9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC33.79■■■■□ 3
STRCQ7RTU9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
STRCQ7RTU9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
STRCQ7RTU9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
STRCQ7RTU9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
STRCQ7RTU9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
STRCQ7RTU9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
STRCQ7RTU9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
STRCQ7RTU9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC33.77■■■■□ 3
STRCQ7RTU9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
STRCQ7RTU9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
STRCQ7RTU9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
STRCQ7RTU9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
STRCQ7RTU9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
STRCQ7RTU9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms