Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BHLHA9Q7RTU4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BHLHA9Q7RTU4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms