Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC137Q6PK04 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms