Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LETMD1Q6P1Q0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms