Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COLEC12Q5KU26 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COLEC12Q5KU26 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms