Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDK2Q58EX2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDK2Q58EX2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDK2Q58EX2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms