Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3M2

SLC5A9, Sodium/glucose cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A9Q2M3M2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A9Q2M3M2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A9Q2M3M2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A9Q2M3M2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms