Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC27Q2M243 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC27Q2M243 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC27Q2M243 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC27Q2M243 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC27Q2M243 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC27Q2M243 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC27Q2M243 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC27Q2M243 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC27Q2M243 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC27Q2M243 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC27Q2M243 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC27Q2M243 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC27Q2M243 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC27Q2M243 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC27Q2M243 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC27Q2M243 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC27Q2M243 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC27Q2M243 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC27Q2M243 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC27Q2M243 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC27Q2M243 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC27Q2M243 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC27Q2M243 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC27Q2M243 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC27Q2M243 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CCDC27Q2M243 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CCDC27Q2M243 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC27Q2M243 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC27Q2M243 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.9 ms