Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC18A3Q16572 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
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